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    【华智产品汇】高通量+低成本+无污染:华智生物DNA提取的专利方

    作者:[db:作者] 时间:2021-06-04 17:25

    编者按

    动植物不同组织的DNA提取是开展分子遗传研究和分子育种应用的第一步。作为国内领先的生物种业行业性关键共性技术平台,华智生物拥有高通量、低成本、无污染的DNA提取专利方法和技术体系,装备有高通量组织研磨机、TECAN液体处理系统、96通道全自动核酸提取仪等仪器设备,可以实现动植物不同组织快速、高质量的DNA提取,每日提取量最高达10000份,满足大规模分子标记筛选、转基因检测等不同分子育种应用场景。今天,小编就为大家介绍华智生物DNA提取的两个专利技术,同时也欢迎大家使用华智生物的技术平台,共同推动动植物的分子育种应用。

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    LGC基因分型系统

    的replikator

    贝克曼的高速板式

    离心机

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    高通量

    组织研磨仪

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    专利1

    一种高通量水稻叶片DNA提取的方法

    叶片是DNA提取的常用组织。利用CTAB等方法提取的水稻叶片DNA可以满足KASP(即竞争性等位基因特异性PCR,Kompetitive Allele Specific PCR)基因型分型的要求,而在在高通量的基因型分型设备Array tape上也能得到较好的结果。但这种DNA提取方法耗时长,通量低,并且用到大量氯仿等有毒有机溶液,仅适用于测序或基因芯片等对于DNA质量要求高的实验,对于大规模高通量叶片DNA提取如基因鉴定,纯系材料少量标记分型等则非常不适宜。因此开发不使用有毒有机试剂的快速提取水稻叶片DNA的方法是非常必要的。

    通过赫然等 “快速制备水稻基因组DNA PCR模板的煮沸法” (植物学生理学通讯,2003),我们知道利用TE缓冲液进行沸水浴可以提取水稻叶片DNA,该DNA可以满足普通PCR实验的要求。我们希望找到一种可以进行高通量水稻叶片DNA提取的方法,并且可以满足KASP基因型分型的要求。

    华智生物发明的一种高通量水稻叶片DNA提取方法,可以很好地满足高通量的KASP基因型分型的要求。本发明技术方案包括:取适量水稻叶片放入适当容器中,置于55-65℃条件下烘烤至干(一般烘烤60-90min);研磨;然后加入DNA提取液,混匀后进行提取;将提取液离心;取适量上清液,加入19-60体积倍(优选29-59体积倍)的超纯水,混匀,即得DNA。

    本发明方法的优点是不使用任何一种有机溶剂,安全无毒;同时无需用液氮进行处理,烘箱烘干叶片的操作方法对实验条件依赖度低,容易实现,且对结果没有影响;而且高度匹配移液工作站,实现高通量自动化。

    本发明于2017年申请专利保护(专利申请号为201710539435.7)并于2020年8月授权。

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    专利2

    一种水稻种子DNA快速提取方法

    ?相对于水稻叶片组织,因为种子含有种皮且淀粉等物质含量高,DNA提取的难度较大。利用国标法提取的水稻种子DNA可以满足KASP(即竞争性等位基因特异性PCR,Kompetitive Allele Specific PCR)基因分型的要求, LGC 384及1538体系和Array tape上均能得到较好的结果。但这种方法耗时长,通量低,种子研磨难度大,并且用到大量氯仿等有毒有机溶液,仅适用于种子真实性检验,对于大规模高通量单粒种子DNA提取如纯度鉴定,纯系材料少量标记分型等则非常不适宜。因此开发不使用有毒有机试剂的快速提取水稻单粒种子DNA的方法是非常必要的。

    通过赵国珍等“一种高效便捷的水稻DNA提取法及其应用(《中国水稻科学》, 2012)”及郑秀婷文章“Non-destructive high-throughput DNA extraction and genotyping methods for cotton seeds and seedlings”,我们知道HOTSHOT法提取的水稻DNA种子,可以在一定条件下满足KASP要求(96体系可行,384和1536体系未知)。但水稻种子高通量研磨较叶片要难很多,因此我们希望得到在不需要研磨种子的前提下,能提取满足KASP要求的种子DNA的方法。

    有鉴于此,华智生物发明了一种水稻种子DNA快速提取方法,该方法能从水稻种子中高效、快速、简便的提取模板DNA,满足KASP要求,不仅不需要使用氯仿等有机溶剂而且不需要研磨种子。该方法具体包括将水稻去壳种子用适量buffer A温浴后再加入适量buffer B,充分振荡均匀后离心,取适量上清液加入适量异丙醇充分振荡均匀后置于-20℃冰箱中一定时间,再离心弃上清,将沉淀物干燥,加入适量超纯水溶解;即得DNA样品。

    与现有的水稻DNA 提取方法相比,本发明具有如下优点:不需要使用氯仿等有机试剂,水稻不需要研磨成粉即可提取DNA,提取的DNA可以在KASP标记0.8ul的反应体系下很好的扩增。

    该发明于2017年申请专利保护(专利申请号为201710538088.6)并于2020年10月授权。

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