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    python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

    栏目:代码类 时间:2020-01-13 21:10

    主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

    使用到的python库:SimpleITK

    下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

    import SimpleITK as sitk
    import numpy as np
    import cv2
    
    def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
      lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
      newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
      newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
      cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])
    
    if __name__ == '__main__':
    
      # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
      dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
      output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
      ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
      img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
      # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
      #类似于 (1,height,width)的形式
      shape = img_array.shape
      img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
      high = np.max(img_array)
      low = np.min(img_array)
      convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
      print('FINISHED')
    

    以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持IIS7站长之家。

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